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SimVector官方版是一款功能強大的質粒圖譜繪制軟件,能夠幫助用戶輕松繪制出需要的矢量地圖,為用戶的質粒圖譜繪制工作提供了幫助。軟件支持繪制各種圖案、顏色、字體和類型的圓形和線性矢量地圖,滿足用戶的各種質粒圖譜繪制需求。
一、計劃克隆實驗
1、設計網關克隆實驗:使用SimVector,您可以執行構成 Gateway?克隆的BP和LR反應。供體載體和表達載體是BP反應和產生進入克隆所必需的。LR反應和生成表達載體需要入口載體和目標載體。
2、設計TA克隆載體:SimVector可以輕松設計 TA克隆實驗。TA克隆向導接受商業T載體或限制性設計的T載體,并將其與經修飾的PCR產物組合。然后,您可以生成高度準確的重組DNA質粒圖譜。
3、進行限制性克隆:克隆技術需要限制性酶切割載體分子和待克隆的分子。SimVector執行限制酶分析,并允許您對所需序列上的限制酶進行過濾,注釋和映射。
4、執行限制分析:使用超過1000種限制酶的綜合數據庫進行限制性分析。SimVector識別DNA序列中的限制酶識別位點,用于測定限制酶。提供兩種酶過濾模式來指定限制性分析的參數。酶過濾使您能夠設置酶標準以符合您的實驗要求。為方便起見,包括來自20多家商業供應商的酶套。
二、繪制目錄質量質粒圖
1、繪制質粒圖:用SimVector繪制出版質量質粒圖。
2、多重克隆站點(MCS)顯示:SimVector通過解釋GenBank頭文件注釋(可用)來識別MCS,或者您可以手動指定。
3、支架視圖顯示:它甚至有聰明的只列出在MCS內切割的酶和其他地方。這種特殊格式我們稱之為“括號視圖”。
4、目錄質量矢量圖形: SimVector生成矢量圖形格式的質粒圖,用于導出到adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002。
5、導出網絡就緒圖像:以JPEG,PNG和TIF格式導出高分辨率質粒圖,便于網站添加,導出圖像可以進行主機頁面。
6、圖形Entrez特性:將GenBank注釋轉換為圖形特征(線性和圓形序列圖)。
7、創建向量:創建向量圖,而不知道其序列。
三、自定義矢量地圖
1、簡單樣式:從數百種字體,顏色,樣式和限制酶和功能的填充模式中選擇一個按鈕。
2、顏色主題:定義您自己的自定義顏色主題并重復應用。
3、選框選擇:組選擇對象以快速設置所有樣式。
4、線性和圓形視圖:顯示圓形和線性質粒圖。
5、縮放:放大查看詳細圖形或進行概覽。
6、文本:添加文本以注釋質粒圖。
1、繪制卓越的出版質量質粒圖
無論您是銷售工程質粒的目錄公司還是對重組克隆實驗進行限制性分析,SimVector將幫助您模擬實驗,并從頭至尾創建出版質量質粒圖。使用軟件繪制各種顏色,圖案,字體和線條類型的圓形和線性質粒圖。以斜體顯示細菌部分的兩種字體樣式顯示酶名稱,如傳統的。在質粒圖中包含特征注釋的任何位置,在單個文本字中使用多種字體樣式和顏色。
2、多重克隆站點
矢量目錄通常以獨特的格式顯示MCS,其中酶在垂直列表中一個上。SimVector通過解釋GenBank標題注釋來識別MCS,或者您可以手動指定它們。然后,它們以我們稱為“括號視圖”的特殊格式繪制。它甚至有聰明的人只列出在MCS和其他地方切割的酶。
3、閃電快速克隆模擬
SimVector將GenBank或??本地文件的序列標題中的注釋轉換為完全說明的地圖??寺∠驅Э梢砸龑瓿闪餍械闹亟M方案,例如Gateway克隆和TA克隆,以及一個和兩個酶限制性克隆。ORF搜索可以幫助您確保構造保留在框架內。點擊一個按鈕,您可以翻譯表達蛋白質的序列,以檢查可能的閱讀框錯誤。使用SimVector,克隆模擬就像點擊幾個按鈕一樣簡單。
4、限制分析
SimVector具有全面的限制酶分析功能。從一千多種限制性酶的數據庫中選擇,或者使用我們預先加載的普遍的商業酶庫。SimVector還使您可以構建自己的定制酶組。
5、生物學家設計的直觀界面
SimVector具有直觀的生物學家設計的界面,可進行限制性克隆和序列分析。點擊向導使得即使對于初學者也很容易使用,而多功能功能可以完全控制專家繪制質粒圖。