網友評分: 5分
pymol是一款功能十分強大的三維分子模型分析軟件,該軟件集成了最新的光線追蹤技術,內置了豐富的小工具合集,能夠幫助用戶輕松地搭建出分子模型,操作簡單易上手,可根據用戶的需求搭建出各種規格的3D分子模型,今天小編為大家帶來了這款軟件的教育版,該版本專門針對高校用戶量身定制,喜歡的小伙伴千萬不要錯過哦。
借助此分子可視化系統,可以以3D模式對蛋白質,其密度,軌跡和表面進行細微分析
原生視網膜分辨率/ 4k顯示支持
新的APBS插件面板
pymolrc腳本編輯器,突出顯示語法
???取消停靠并重新排列某些面板(生成器,反饋瀏覽器,音量編輯器)
支持觸控板手勢(捏放大/縮小,z旋轉)
用于打開MAE文件,MTZ文件,地圖和軌跡文件的專用對話框
Window系統的pymol運行需要依賴python環境,PMW模塊。
而Pymol的安裝是通過一個python包(Python Wheels)安裝的,因此在開始之前,我們需要根據系統的位數(32位還是64位)以及python的版本來選擇pymol包進行下載。
比方說,系統是windows 64位,系統中有python 3.7(或者打算安裝python 3.7),那么我們就可以有2個選擇,可以選擇下載pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl或者pymol-2.4.0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl,對應的版本分別是pymol 2.3和pymol 2.4.
安裝python環境
1、如果系統中已經有了python環境,則跳過這一步??梢酝ㄟ^命令行:python –V來查看python的版本號。
2、進入python官網下載windows版的安裝包
3、注意的是下載的安裝包要和windows系統位數對應,x86對應的是32位系統;x86-64對應的是64位系統,我們就以python 3.7為例,由于我們的系統是64位的,4、所以下載的安裝包為:Windows x86-64 executable installer
5、下載完成后,雙擊進行安裝,記得勾選上Add Python to environment variables,不然后續命令行操作會出現問題。
6、如果安裝成功,Win+R,cmd進入命令行,鍵入python –V就可以看到python的版本號,同時也說明安裝成功。如果報錯“python不是內部或外部命令,也不是可運行的程序或批處理文件。”那么說明python的地址沒有加入環境變量。
安裝PMW
命令行鍵入:python -m pip install pmw
提示說成功安裝pmw,Successfully installed pmw-2.0.1
下載并安裝pymol包
根據系統位數和python版本選擇某個pymol包進行下載,放在某個磁盤根目錄。在這里,我們選擇安裝pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl,并放在D:/根目錄。
命令行下,將盤符切換到D:盤,鍵入命令:python -m pip install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl
提示安裝成功
找到pymol主程序的位置
本文中pymol的主程序地址為:C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe
其中紅色背景部分應該會與不同電腦設置及python版本相一致。
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