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Gene Runner 是一款專業實用的生物基因分析工具。它能夠幫助實驗室工作人員的基因進行數據模擬分析,讓數據能夠可視化提供我們查看,支持多種序列分析,您可以在一個界面上模擬不同組的序列,利用顏色以及圖形的方式區別基因組的變化過程。
Gene Runner軟件允許你搜索序列或蛋白質相匹配的全部或部分的當前文件的多個在線數據庫。另外,你可以搜索軟件的starblast服務器,與NCBI的BLAST或文本服務器。執行任何應用網絡搜索菜單Gene Runner軟件在線搜索。
你可以開始一個Editseq項目空或空白文檔,或者你可以從各種格式的文件,打開一個現有的序列。如果序列文件長于需要,可以通過坐標指定序列的子范圍。
你也可以從一個數據庫訪問Internet或Intranet輸入序列,如DNASTAR的starblast或NCBI的Entrez數據庫。
Editseq顯示DNA或蛋白質序列和相關的評論和特點三可調的窗格。進入一個新的序列,輸入適當的Iub核苷酸或蛋白質編碼。一旦你輸入了一個序列,你可以選擇將殘基分成三胞胎,十列,或者你選擇的另一組。檢查精度的順序使用Editseq的校對和語音驗證功能。
Editseq的搜索功能讓你找到位置,開放閱讀框的瞬間。此外,還可以對序列的任何部分或部分進行反轉、補充或查看統計信息。您也可以翻譯DNA序列或反向翻譯蛋白質序列使用定制,表達特定的遺傳密碼。
你可以寫寫序列的任何意見直接進入的Editseq窗口中間窗格。默認情況下,當打開序列時,將在下窗格中顯示。您也可以創建自己的注釋,帶或不帶翻譯,并在一個共同的標題和描述下連接幾個功能。
基因的運動員是專業的應用旨在提供遺傳學家和生物學家提供一個可靠的工具,可以幫助他們輕松地進行基因分析。
發現限制性位點
酶限制圖方法位于更多方法菜單中,使您能夠創建限制性映射。
在確定限制位點后,可以通過選擇瓊脂糖凝膠模擬命令來預測瓊脂糖凝膠的限制性片段的電泳分離。在查看模擬凝膠時,您可以將光標移到任何片段上,以顯示其范圍、大小和限制切割每個末端的限制酶的頭。
應用程序需要的格式文件所包含的遺傳信息,然后可以使用“ORF分析”(開放閱讀框)按鈕,可以讓用戶設置優先核苷酸或氨基酸的大小,以及選擇工作表的翻譯。開放的ORF的項目后,用戶可以對每個條目進行各種注釋。
矩陣模式
這種方法,位于更多的方法部分,發現序列特征,如起始位點,剪接受體位點和剪接供體位點。矩陣模式是在單獨的數據文件中定義,Gene Runner軟件\矩陣式文件夾(MAC)。而由密碼子預測方法確定的起始密碼子是簡單框架ATGs,矩陣模式方法考慮局部序列與預測功能的子集為ATGS起始密碼子的目的。
允許你同步更新兩個工作在相同的文件在任何或所有五lasergene應用在同一時間。這樣的變化在一個應用程序將自動應用的兩個相同的共享數據的其他應用程序。
開放和節省開允許你在任何序列文件的命名和保存應用以上文件的格式,這是usable市“任何的其他應用程序。
“限制性分析”功能的基因流道,用戶只需檢查的序列的一部分,通過進入優選的切位點。此外,他們可以分析所有的酶的類型或復發/非回文。此功能還提供了用戶設置一個精確的分析區域和丟棄出挑的選項。