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Primer Premier Win10是一款非常專業的引物設計軟件,該軟件支持引物設計、限制性內切酶位點分析和DNA基元(motif)查找等功能,真正做到快速化和自動化操作流程,帶來無與倫比的設計體驗,并且該版本為破解版,內置破解補丁,免激活碼即可永久免費進行使用。
1、主要界面可分為序列編輯窗口(Genetank),引物設計窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和紋基分析窗口(Motif)四大塊
2、該軟件就是用來進行引物設計的
3、可以簡單地通過手動拖動鼠標以擴增出相應片段所需的引物
4、在手動的任何時候,下面顯示各種參數的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發夾結構等。也可以給定條件,讓軟件自動搜索引物,并將引物分析結果顯示出來
5、進行這些操作非常簡單
1、下載軟件壓縮包文件,點擊“PP624Installer.exe”根據提示完成原版安裝即可
2、關閉軟件,將crack文件夾下的patcher.jar文件復制到Premier 6安裝根目錄下…\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM624文件夾中。
默認目錄為:C:\Program Files\Primer Premier 6.24
3、在開始菜單—運行中輸入CMD,打開命題提示符窗口
4、用CD命令定位至目錄:
cd C:\Program Files\Primer Premier 6.24\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM624
7、然后在光標后輸入:java -jar patcher.jar ,回車即可破解成功
一、限制性酶切點分析及基元查找功能
1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切點分析及基元查找功能比較簡單,點擊該功能按鈕后,選擇相應的限制性內切酶或基元(如-10 序列,-35 序列等),按確定即可
2.常見的限制性內切酶和基元一般都可以找到,你還可以編輯或者添加新限制性內切酶或基元
二、引物設計
1.打開DNA序列后點擊按鈕primer,出現“search criteria”窗口,有多種參數可以調整
2.搜索目的(Seach For)有三種選項,PCR 引物(PCR Primers)、測序引物(Sequencing Primers)和雜交探針(Hybridization Probes)
3.搜索類型(Search Type)可選擇分別或同時查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或者成對查找(Pairs),或者分別以適合上、下游引物為主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外還可改變選擇區域(Search Ranges),引物長度(Primer Length),選擇方式(Search Mode),參數選擇(Search Parameters)等等
3.使用者可根據自己的需要設定各項參數。如果沒有特殊要求,建議使用默認設置。然后按search,隨之出現的Search Progress 窗口中顯示Search Completed 時,再按OK,這時搜索結果以表格的形式出現,有三種顯示方式,上游引物(Sense),下游引物(Anti-sense),成對顯示(Pairs)。默認顯示為成對方式,并按優劣次序(Rating)排列,滿分為100,即各指標基本都能達標
三、引物點擊
1.點擊其中一對引物,如第1#引物,并把上述窗口挪開或退出,顯示“Peimer Premier”主窗口,所得結果分三部分,
2.模板及產物位置,中間是所選的上下游引物的一些性質,最下面是四種重要指標的分析,包括發夾結構(Hairpin),二聚體(Dimer),錯誤引發情況(False Priming),及上下游引物之間二聚體形成情況(Cross Dimer)
3.當所分析的引物有這四種結構的形成可能時,按鈕由變成,點擊該按鈕,在左下角的窗口中就會出現該結構的形成情況
4.一對理想的引物應當不存在任何一種上述結構,因此最好的情況是最下面的分析欄沒有,只有。值得注意的是中間一欄的末尾給出該引物的最佳退火溫度
四、引物修飾編輯
1.在需要對引物進行修飾編輯時,如在5’端加入酶切位點,可點擊,然后修改引物序列
2.若要回到搜索結果中,則點擊按鈕。如果要設計簡并引物,只需根據源氨基酸序列的物種來源選擇前述的八種遺傳密碼規則,反推至DNA 序列即可3.對簡并引物的分析不需像一般引物那樣嚴格
4.總之,“Premier”有優秀的引物自動搜索功能,同時可進行部分指標的分析,而且容易使用,是一個相當不錯的軟件
標簽: Primer Premier 引物設計
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