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DNAMAN是一款非常好用序列分析工具,它可以幫助用戶完成所有日常核酸和蛋白質序列分析工作,包括多重序列比對、PCR引物設計等各種操作,是生物學家的必備軟件,肯定可以幫助你提高科學工作的效率。
1、DNA和蛋白質序列編輯
2、DNA序列轉化
3、多序列比對,對齊編輯和分析
4、系統樹分析
5、DNA或蛋白質序列的點陣比較
6、DNA序列組裝和編輯
7、BLAST通過網絡界面在Intranet/Internet Server上進行搜索
8、序列和數據庫中的增強型圖案搜索
9、SiRNA選擇器
10、限制分析
11、繪制序列圖與出版品質
12、限制模式預測
13、電子克隆
14、從限制片段重建限制圖
15、靜音突變分析創建/破壞限制性位點
16、導向不匹配以創建/破壞限制站點
17、翻譯和密碼子使用分析
18、蛋白質疏水性/親水性分析
19、蛋白質表征:等電點的序列組成和預測
20、蛋白質二級結構預測
21、反向翻譯
22、PCR和測序引物的設計
23、表征DNA或引物序列的熱力學性質
24、分歧分析
25、管理寡核苷酸,DNA和蛋白質數據庫
26、生成隨機序列
1、首先在本站下載文件并解壓,雙擊DNAMAN 9.exe程序進行安裝
2、這里我們使用默認路徑,點擊next
3、點擊install開始安裝
4、軟件正在安裝,請耐心等待
5、安裝完成,點擊finish,先不要運行軟件
6、安裝完成后將破解補丁復制到安裝目錄下替換源文件即可,一般默認安裝目錄為:C:\Program Files (x86)\DNAMAN
1、數據庫管理
選擇數據庫|經理命令打開數據庫管理器”對話框。
2、DNA和蛋白質數據庫
該軟件的數據庫功能,允許用戶組織DNA和蛋白質序列的不同科目。
3、編輯記錄信息
有關特定記錄的信息可以編輯,在序列列表框中,所有記錄按字母順序或記錄順序列出,每個記錄名字的數量顯示記錄的記錄號ID.用DNAMAN自動分配。因此,您可以為不同的記錄使用相同的名稱。
4、掃描序列的相似性
它掃描所有的序列記錄在默認的數據庫搜索當前序列的同源序列。如果默認數據庫包含DNA序列,則默認序列必須是DNA序列,如果默認數據庫包含蛋白質序列,則默認序列必須是蛋白質序列。DNAMAN將使用快速對準方法掃描數據庫的序列相似性,您可以選擇對結果的最終輸出使用快速對齊或最佳對齊方式。
5、錯配分析
錯配分析的目的是找到所有可能的退火位點的DNA序列的引物在默認,此功能可用于PCR和DNA測序的引物選擇,權重矩陣用來區分引物位置的重要性。由于引物在3’末端對目標DNA的匹配比PCR擴增的5末端更重要,所以更多的權重被賦予3’末端。為了提高PCR引物的特異性,應始終檢查引物與靶DNA之間是否存在次級退火位點。
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